菠蘿蛋白酶廣泛存在于菠蘿的果實、芽、葉、莖中，從菠蘿的果實中提取的稱為菠蘿蛋白酶，從菠蘿的莖中提取的莖菠蘿蛋白酶。它水解蛋白的活性比木瓜蛋白酶的活性高10倍以上，因此有著廣泛的用途。

　　因此，如何對菠蘿蛋白酶進行濃縮分離是很重要的。傳統工藝：有機溶劑沉淀法，單寧沉淀法和高嶺土吸附法。生產工藝周期長，菠蘿汁容易變質。會使產品比活力不高；而且操作都比較復雜，原料消耗量大，酶活力的總收率低。如果，運用了超濾技術，情況就會大大的不同。

　　超濾法是膜分離技術中典型的一種，用超濾濃縮后的濃縮液，可大大節約輔助原料的用量，簡化了工藝流程，總生產成本減少。而且產品質量好，使用壽命長，性價比高。純度高，酶活力高，酶活力的總回收率高，抗污染性能好，使經濟效益明顯比傳統工藝好。

　　超濾濃縮后的濃縮液，要用有機溶劑沉淀法來提取精酶，由于需要低溫而使生產成本上升，但產品質量、純度、酶活力都優于傳統工藝，是菠蘿蛋白酶升級換代的新工藝。