原果蔬汁經前幾步加工處理后，仍殘留少量有機酸、苦味物質和色素等，往往會破壞果汁飲用時的風味，降低產品質量。

　　果汁脫酸：利用電滲析膜(兩側均用陰膜，酸根一側滲出，另側滲入OH-與H+中和)，可以有效脫除果汁中的有機酸，降低果汁酸度，提高產品質量和口感。

　　果汁脫色：果汁不僅可以使用各種合成樹脂進行脫色處理，還可以采用超濾技術進行處理。用聚酯醚砜(PES)/聚乙烯吡咯烷酮(PVP)復合膜超濾技術脫除蘋果汁中31%的色素，截留分子量為20～50KDa的超濾膜對紅霉果漿廢水中的花青素的回收率達80%。

　　果汁脫苦：柑橘類果汁柚皮苷、類檸檬苦素等的存在，極大地影響破壞了產品的品質和商業價值。目前可采取吸附、超臨界CO2脫苦等方式，此外，超濾技術能有效降低果汁中苦味物質含量。例如，利用超濾和樹脂吸附的聯合過程對葡萄柚汁進行脫苦，柚皮苷、類檸檬苦素幾乎完全脫除，分離效果極高，但由于膜性能不夠穩定，還沒有實現大規模工業使用。